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最大加权平均选择器

本文件是 TPOT 库的一部分。

当前版本的 TPOT 由 Cedars-Sinai 的以下人员开发: - Pedro Henrique Ribeiro (https://github.com/perib, https://www.linkedin.com/in/pedro-ribeiro/) - Anil Saini (anil.saini@cshs.org) - Jose Hernandez (jgh9094@gmail.com) - Jay Moran (jay.moran@cshs.org) - Nicholas Matsumoto (nicholas.matsumoto@cshs.org) - Hyunjun Choi (hyunjun.choi@cshs.org) - Gabriel Ketron (gabriel.ketron@cshs.org) - Miguel E. Hernandez (miguel.e.hernandez@cshs.org) - Jason Moore (moorejh28@gmail.com)

TPOT 的原始版本主要由宾夕法尼亚大学的以下人员开发: - Randal S. Olson (rso@randalolson.com) - Weixuan Fu (weixuanf@upenn.edu) - Daniel Angell (dpa34@drexel.edu) - Jason Moore (moorejh28@gmail.com) - 以及许多其他慷慨的开源贡献者

TPOT 是自由软件:您可以根据自由软件基金会发布的 GNU 宽通用公共许可证(版本 3 或您选择的任何更高版本)的条款重新分发和/或修改它。

分发 TPOT 是希望它会有用,但 **不提供任何担保**;甚至不提供适销性或特定用途适用性的默示担保。更多详情请参阅 GNU 宽通用公共许可证。

您应该已经随 TPOT 收到了 GNU 宽通用公共许可证的副本。如果未收到,请参阅 https://gnu.ac.cn/licenses/

max_weighted_average_selector(scores, k, n_parents=1, rng=None)

根据最大加权平均选择,选择最佳个体,重复 k 次。

参数

名称 类型 描述 默认值
scores ndarray

分数矩阵,其中行是不同的个体,列对应于不同目标的分数。

必填
k int

要选择的个体数量。

必填
n_parents int

每个个体要选择的父代数量。默认值为 1。

1
rng (int, Generator)

随机数生成器。默认值为 None。

None

返回值

类型 描述
一个形状为 (k, n_parents) 的选定个体索引数组。
源代码位于 tpot/selectors/max_weighted_average_selector.py
def max_weighted_average_selector(scores,k, n_parents=1, rng=None):
    """
    Select the best individual according to Max Weighted Average Selection, *k* times.

    Parameters
    ----------
    scores : np.ndarray
        The score matrix, where rows the individuals and the columns are the corresponds to scores on different objectives.
    k : int
        The number of individuals to select.
    n_parents : int, optional
        The number of parents to select per individual. The default is 1.
    rng : int, np.random.Generator, optional
        The random number generator. The default is None.

    Returns
    -------
        A array of indices of selected individuals of shape (k, n_parents).

    """
    ave_scores = [np.nanmean(s ) for s in scores ] #TODO make this more efficient
    chosen = np.argsort(ave_scores)[::-1][0:k] #TODO check this behavior with nans
    return np.reshape(chosen, (k, n_parents))